Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Ddx60E9PZQ1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Ddx60E9PZQ1 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ddx60E9PZQ1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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