Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rsph10bE9PYQ0 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rsph10bE9PYQ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms