Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sbf2E9PXF8 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sbf2E9PXF8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sbf2E9PXF8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms