Protein–RNA interactions for Protein: E9PWZ3

Rpl3l, Ribosomal protein L3-like, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3lE9PWZ3 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rpl3lE9PWZ3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl3lE9PWZ3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl3lE9PWZ3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms