Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Vpreb3D3Z6J4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Vpreb3D3Z6J4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms