Protein–RNA interactions for Protein: B2RT89

Slc22a28, Predicted gene, EG434674, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a28B2RT89 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Slc22a28B2RT89 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Slc22a28B2RT89 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Slc22a28B2RT89 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms