Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apol7aB2RT54 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Apol7aB2RT54 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Apol7aB2RT54 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms