Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Uhrf1bp1B2KF50 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Uhrf1bp1B2KF50 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms