Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll11A4Q9F4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll11A4Q9F4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ttll11A4Q9F4 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms