Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUG2

Polk, DNA polymerase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolkQ9QUG2 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm29521-201ENSMUST00000187061 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Lsm8-204ENSMUST00000201141 503 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Gm8020-201ENSMUST00000170174 1406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Fbxo40-202ENSMUST00000114806 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
PolkQ9QUG2 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm13094-201ENSMUST00000117930 409 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
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PolkQ9QUG2 Dusp3-207ENSMUST00000176261 496 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 2610016A17Rik-201ENSMUST00000185211 474 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 1700009J07Rik-202ENSMUST00000185309 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 AC164429.1-201ENSMUST00000224210 518 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Ifitm7-201ENSMUST00000117803 853 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Mir432-201ENSMUST00000157230 75 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm27211-201ENSMUST00000183507 631 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Olfr1358-201ENSMUST00000204477 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Rpl15-ps5-201ENSMUST00000205636 605 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 AC162938.2-202ENSMUST00000215497 722 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Rp9-204ENSMUST00000216973 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Olfr435-201ENSMUST00000058118 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
PolkQ9QUG2 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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