Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Adgrl3-217ENSMUST00000121707 6690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Nop56Q9D6Z1 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Kcnk5-201ENSMUST00000024011 3392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Dcun1d2-203ENSMUST00000110839 2937 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Epb41l5-202ENSMUST00000052404 6442 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Sphk2-202ENSMUST00000107737 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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Nop56Q9D6Z1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Plxna3-201ENSMUST00000004326 6943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 2810032G03Rik-202ENSMUST00000163627 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 1700018A04Rik-204ENSMUST00000221561 2569 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Fmod-201ENSMUST00000048183 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 2010320M18Rik-201ENSMUST00000191396 1009 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Nop56Q9D6Z1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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