Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Actg2-202ENSMUST00000121731 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Omt2b-203ENSMUST00000187667 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gimd1-205ENSMUST00000212852 1234 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Gm8809-201ENSMUST00000119367 743 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm8163-201ENSMUST00000122020 1060 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm11770-201ENSMUST00000135048 548 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Gm20467-201ENSMUST00000172872 994 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Nudt7-203ENSMUST00000109109 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Tmem108-203ENSMUST00000189066 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm42849-201ENSMUST00000202834 1584 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm12047-201ENSMUST00000117561 944 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm13799-201ENSMUST00000138883 838 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Vmn2r-ps13-201ENSMUST00000176920 606 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm9117-201ENSMUST00000177735 1098 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm29200-201ENSMUST00000188118 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Lrrc9Q8CDN9 Gm19228-201ENSMUST00000214030 717 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 CT025642.1-201ENSMUST00000224734 1219 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm11437-201ENSMUST00000050771 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Rps4l-ps-201ENSMUST00000059737 768 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gfra2-203ENSMUST00000227697 1323 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Vps45-201ENSMUST00000015891 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Elf2-213ENSMUST00000195432 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc9Q8CDN9 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms