Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 9230105E05Rik-201ENSMUST00000161291 2250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12400-201ENSMUST00000120915 1003 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Zfp738-202ENSMUST00000125495 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm25026-201ENSMUST00000175017 188 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm37676-201ENSMUST00000195496 507 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm5717-201ENSMUST00000198243 1062 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm4887-201ENSMUST00000122230 1053 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm13605-201ENSMUST00000124489 658 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Olfr1471-201ENSMUST00000096203 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ssuh2Q8C3L1 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms