Protein–RNA interactions for Protein: P97793

Alk, ALK tyrosine kinase receptor, mousemouse

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Length 1,621 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AlkP97793 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Micu1-212ENSMUST00000179709 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pced1b-204ENSMUST00000228521 1790 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AlkP97793 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 6430531B16Rik-202ENSMUST00000121412 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm26901-202ENSMUST00000193106 256 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Clrn1-201ENSMUST00000051408 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Osbp2-201ENSMUST00000070552 4097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Krt34-201ENSMUST00000056362 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Upp1-202ENSMUST00000101525 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm14320-201ENSMUST00000137275 1023 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Platr17-201ENSMUST00000172817 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm26725-201ENSMUST00000180652 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm16619-201ENSMUST00000181817 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm7833-201ENSMUST00000183288 990 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ifnl3-201ENSMUST00000078364 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AlkP97793 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Igll1-201ENSMUST00000100136 870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm7861-201ENSMUST00000110749 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm7849-201ENSMUST00000110752 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm11544-201ENSMUST00000120215 382 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
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AlkP97793 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm42375-201ENSMUST00000206226 745 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Fcer2a-205ENSMUST00000208145 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ms4a7-202ENSMUST00000056035 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm13608-201ENSMUST00000121807 1406 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm17782-201ENSMUST00000174345 880 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm4705-201ENSMUST00000177415 354 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm8643-201ENSMUST00000195228 625 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm18555-201ENSMUST00000197935 584 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 AC154347.2-201ENSMUST00000221223 715 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
AlkP97793 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms