Protein–RNA interactions for Protein: P23812

Hoxd12, Homeobox protein Hox-D12, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd12P23812 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm15498-201ENSMUST00000126693 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ppy-202ENSMUST00000170554 487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm25872-201ENSMUST00000177784 100 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 E030026E10Rik-201ENSMUST00000200395 2217 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm17226-201ENSMUST00000166637 780 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm8234-201ENSMUST00000198523 1107 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Gm18123-201ENSMUST00000210874 822 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Chordc1-202ENSMUST00000213605 519 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Grk3-204ENSMUST00000197888 1938 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Hoxd12P23812 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
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