Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Msh3-201ENSMUST00000022220 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
TP20293 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Tfam-201ENSMUST00000092430 4167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Kalrn-211ENSMUST00000114966 3857 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Txlng-201ENSMUST00000041370 3862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Dcun1d4-203ENSMUST00000113558 4023 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Mtss1l-205ENSMUST00000144041 3225 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Ccdc63-201ENSMUST00000058960 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
TP20293 Gabre-201ENSMUST00000064780 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Abt1-201ENSMUST00000041782 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Zfp773-201ENSMUST00000032622 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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TP20293 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 2610005L07Rik-201ENSMUST00000139264 948 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm21092-201ENSMUST00000178995 955 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm10254-201ENSMUST00000052888 867 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
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