Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Xlr4e-ps-201ENSMUST00000122102 648 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm26254-201ENSMUST00000122491 118 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm25047-201ENSMUST00000122667 104 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm12923-201ENSMUST00000127060 667 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm16243-201ENSMUST00000160351 494 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm18588-201ENSMUST00000177308 492 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm7572-201ENSMUST00000182616 766 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Reg1-202ENSMUST00000204601 766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm17850-201ENSMUST00000210023 1154 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15965-201ENSMUST00000123318 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Igsf1-203ENSMUST00000114891 1761 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm37598-201ENSMUST00000194506 1301 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm13456-201ENSMUST00000118928 1365 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Trbv3-201ENSMUST00000103264 455 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ighv14-3-201ENSMUST00000103469 399 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm6158-201ENSMUST00000109467 904 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm11480-201ENSMUST00000120214 659 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Pla2g1b-204ENSMUST00000145785 419 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm16588-201ENSMUST00000162889 355 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm3298-202ENSMUST00000172110 615 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm5976-201ENSMUST00000180794 996 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 4933417D19Rik-201ENSMUST00000181432 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm26610-201ENSMUST00000181529 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm26715-201ENSMUST00000181676 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 1700040F17Rik-201ENSMUST00000187158 817 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm43506-201ENSMUST00000200675 753 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr8-202ENSMUST00000203851 1009 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm44212-201ENSMUST00000205016 897 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm18268-201ENSMUST00000208445 943 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC167192.1-201ENSMUST00000225908 139 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm17541-201ENSMUST00000080062 525 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Olfr1154-201ENSMUST00000099844 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Hoxb4P10284 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
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