Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V9

Ccni, Cyclin-I, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcniQ9Z2V9 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mlc1-202ENSMUST00000109368 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ano1-202ENSMUST00000118556 4566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Fbxw4-203ENSMUST00000160003 387 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Shroom2-202ENSMUST00000101141 7494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Celf1-205ENSMUST00000111449 4441 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ankrd11-201ENSMUST00000098333 7995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Vmn1r16-203ENSMUST00000228356 3492 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Shank2-205ENSMUST00000146006 7666 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ddr1-201ENSMUST00000003628 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ablim2-204ENSMUST00000114204 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Prpf6-203ENSMUST00000136481 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Armt1-201ENSMUST00000095893 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
CcniQ9Z2V9 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
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