Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEZ1

Smco1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco1Q8CEZ1 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Astn1-205ENSMUST00000193042 7248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Zfp775-203ENSMUST00000204095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Npc1l1-201ENSMUST00000004505 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Tfdp1-204ENSMUST00000209885 2511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 A930007I19Rik-201ENSMUST00000180737 2319 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Bco1-201ENSMUST00000034308 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Zfp804b-202ENSMUST00000200317 4430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Slc19a1-208ENSMUST00000136925 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Ppef2-202ENSMUST00000201130 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Nfkbiz-204ENSMUST00000114458 3627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gpat4-201ENSMUST00000167004 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Nav2-204ENSMUST00000183659 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Git2-203ENSMUST00000112183 4886 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Tti2-201ENSMUST00000098842 5039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Dctn1-202ENSMUST00000113907 4205 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Man2c1-201ENSMUST00000034836 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Fyn-205ENSMUST00000135242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 1700047M11Rik-202ENSMUST00000189594 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm45699-201ENSMUST00000212838 1576 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Usp47-206ENSMUST00000215510 4697 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Trim9-205ENSMUST00000221041 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Eif2s2-201ENSMUST00000099173 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm7357-201ENSMUST00000195361 2991 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 A830010M20Rik-208ENSMUST00000211896 5256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Arfgap3-201ENSMUST00000067215 2619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Srpx2-201ENSMUST00000033606 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Top1-201ENSMUST00000109468 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Pif1-201ENSMUST00000047099 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Stra6-213ENSMUST00000167479 2871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 S100a3-205ENSMUST00000200508 587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Slc7a3-202ENSMUST00000101362 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Cd163-201ENSMUST00000032234 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Lrfn5-202ENSMUST00000119481 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Smco1Q8CEZ1 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
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