Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Txk-201ENSMUST00000113604 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm30648-202ENSMUST00000200648 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ighmbp2-201ENSMUST00000025751 3720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tmem30c-203ENSMUST00000120112 3478 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dmtn-203ENSMUST00000110984 4176 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pigc-205ENSMUST00000193784 4207 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Clcn6-205ENSMUST00000137724 5198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Snd1-201ENSMUST00000001460 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Zcchc12-202ENSMUST00000115256 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ghsr-201ENSMUST00000057186 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 AC165148.1-201ENSMUST00000224795 2372 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm15979-201ENSMUST00000149741 590 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm17105-201ENSMUST00000163715 652 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Irx1P81068 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.8 ms