Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 4930513D17Rik-203ENSMUST00000202800 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Asap1-202ENSMUST00000110114 4409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
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VdrP48281 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Ap1b1-201ENSMUST00000009234 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
VdrP48281 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
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