Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 5330413P13Rik-205ENSMUST00000210961 913 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Dnm3-202ENSMUST00000086074 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Odf2-209ENSMUST00000113764 2450 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Vti1a-201ENSMUST00000095950 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Acot9-201ENSMUST00000026324 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Acad9-201ENSMUST00000011492 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Anp32e-202ENSMUST00000165307 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Fcer1aP20489 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms