Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1c2-202ENSMUST00000095820 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Theg-201ENSMUST00000020566 1444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm1661-201ENSMUST00000077500 1422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mmachc-201ENSMUST00000030453 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nprl3-202ENSMUST00000109389 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-213ENSMUST00000105952 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-215ENSMUST00000105954 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-216ENSMUST00000105955 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-218ENSMUST00000105958 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cav2-203ENSMUST00000115462 694 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm12736-201ENSMUST00000119330 236 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm16283-201ENSMUST00000149935 522 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm12972-201ENSMUST00000152986 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5543-201ENSMUST00000193329 1091 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm42133-201ENSMUST00000196076 637 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm31786-201ENSMUST00000212305 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm19605-205ENSMUST00000221712 677 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC118639.1-202ENSMUST00000226957 653 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Tnnt3-202ENSMUST00000078497 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Stxbp4-203ENSMUST00000107875 1660 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Atf3-203ENSMUST00000195117 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC154640.1-203ENSMUST00000228316 1618 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mymk-201ENSMUST00000009358 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Irf9-202ENSMUST00000130697 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Wfdc2-203ENSMUST00000109345 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Gm16193-201ENSMUST00000125903 778 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
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Col5a3Q9JLI2 Ssna1-201ENSMUST00000028342 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ankrd45-201ENSMUST00000052245 849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Krtap3-2-201ENSMUST00000092699 1031 ntAPPRIS P1 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 A830018L16Rik-209ENSMUST00000179089 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Serpina1e-202ENSMUST00000122229 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Elmod3-202ENSMUST00000114069 2164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 AC124561.1-202ENSMUST00000228652 1929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Col5a3Q9JLI2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
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