Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Zbed3Q9D0L1 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm7405-201ENSMUST00000121476 1337 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Spata16-202ENSMUST00000108305 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pitpnb-204ENSMUST00000200298 2632 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr29-ps1-201ENSMUST00000117959 963 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm6758-201ENSMUST00000119643 1055 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm12745-201ENSMUST00000121767 214 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ighv5-8-202ENSMUST00000191967 337 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC169511.1-201ENSMUST00000227639 995 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Olfr115-201ENSMUST00000076936 939 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 CT010462.1-202ENSMUST00000222225 2225 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm15984-202ENSMUST00000156466 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Vstm2a-202ENSMUST00000109647 1745 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm22344-201ENSMUST00000122642 278 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mrto4-ps2-201ENSMUST00000164169 549 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 AC167364.1-201ENSMUST00000221495 784 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm9791-201ENSMUST00000060997 447 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Zbed3Q9D0L1 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms