Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Pard3-201ENSMUST00000026921 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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SbsnQ8CIT9 Tex21-202ENSMUST00000218426 1980 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Nup210-202ENSMUST00000113509 6893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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SbsnQ8CIT9 Smchd1-201ENSMUST00000127430 7052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
SbsnQ8CIT9 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
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SbsnQ8CIT9 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
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SbsnQ8CIT9 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
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SbsnQ8CIT9 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
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SbsnQ8CIT9 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
SbsnQ8CIT9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
SbsnQ8CIT9 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SbsnQ8CIT9 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SbsnQ8CIT9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
SbsnQ8CIT9 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
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