Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm5148-203ENSMUST00000108105 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm14650-201ENSMUST00000120400 889 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm26208-201ENSMUST00000158677 124 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm16587-201ENSMUST00000161943 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm25591-201ENSMUST00000177317 94 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Uba52-ps-201ENSMUST00000183770 379 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Trav18-202ENSMUST00000186573 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Speer4f1-201ENSMUST00000076099 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gpatch1-201ENSMUST00000079693 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 1600014C10Rik-201ENSMUST00000067854 3143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Vbp1-201ENSMUST00000033540 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Klra9-202ENSMUST00000112032 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm16235-202ENSMUST00000149562 206 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Klra9-201ENSMUST00000071554 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Dytn-201ENSMUST00000090313 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm14633-201ENSMUST00000121152 470 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm7805-201ENSMUST00000154348 448 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm5766-202ENSMUST00000161633 799 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm3115-202ENSMUST00000177660 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm6337-203ENSMUST00000177662 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm3727-202ENSMUST00000178251 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm29157-201ENSMUST00000188753 612 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 0610033M10Rik-202ENSMUST00000205236 1102 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Fut1-202ENSMUST00000209379 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm8618-201ENSMUST00000097570 432 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm6713-201ENSMUST00000216137 1446 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Als2cr12-206ENSMUST00000191565 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Psme4Q5SSW2 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gast-201ENSMUST00000017309 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm5865-201ENSMUST00000198713 637 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Gm34667-201ENSMUST00000222974 1258 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
Psme4Q5SSW2 Cxcl10-201ENSMUST00000038816 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms