Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Slc7a4-207ENSMUST00000172164 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr1267-ps1-201ENSMUST00000118957 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15782-201ENSMUST00000121073 445 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm42816-201ENSMUST00000198433 325 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18561-201ENSMUST00000206027 804 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Gm6509-201ENSMUST00000098286 1218 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tnxb-201ENSMUST00000087399 12209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Polr3e-201ENSMUST00000033173 4194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Shcbp1lQ3TTP0 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 628.9 ms