Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Nrap-202ENSMUST00000073536 5501 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Setbp1-201ENSMUST00000025430 9953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tctn3-201ENSMUST00000025981 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tfip11-201ENSMUST00000031288 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dcst2-201ENSMUST00000208216 2285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Nlgn1-205ENSMUST00000193603 11807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Apoa1Q00623 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms