Protein–RNA interactions for Protein: P70338

Gfi1, Zinc finger protein Gfi-1, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfi1P70338 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm37826-201ENSMUST00000195329 322 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cycs-202ENSMUST00000161401 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zc3hc1-202ENSMUST00000102992 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Myo16-203ENSMUST00000207477 7169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 E2f8-201ENSMUST00000058745 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Flcn-203ENSMUST00000102697 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Odf2-208ENSMUST00000113763 2364 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gfi1P70338 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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