Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Oprm1-204ENSMUST00000063036 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Defa8P50706 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Cacna1c-226ENSMUST00000219833 7591 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm11571-201ENSMUST00000136820 2396 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ccdc62-202ENSMUST00000165148 3920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Atxn1l-202ENSMUST00000212605 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm5878-201ENSMUST00000113802 4643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rcbtb2-219ENSMUST00000169513 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Nos1ap-203ENSMUST00000160466 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hrh1-201ENSMUST00000088987 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Chml-204ENSMUST00000211207 1866 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm43184-201ENSMUST00000197247 542 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Col4a6-201ENSMUST00000101205 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gdi1-201ENSMUST00000015435 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Cutal-203ENSMUST00000113068 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hmg20a-205ENSMUST00000215269 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Sla2-202ENSMUST00000109561 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Mecomos-201ENSMUST00000125611 5510 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Dysf-202ENSMUST00000089595 6613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Phtf1os-201ENSMUST00000160110 4046 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Defa8P50706 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms