Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DDX5-235ENST00000630471 473 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SEZ6L-206ENST00000404234 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LMAN2L-202ENST00000377079 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GTF3C6Q969F1 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.2 ms