Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 2310009A05Rik-201ENSMUST00000184126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm44196-203ENSMUST00000204359 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm8268-201ENSMUST00000209683 458 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm30504-201ENSMUST00000209316 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Adgb-201ENSMUST00000045328 1893 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm42493-201ENSMUST00000197559 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm32743-201ENSMUST00000214196 594 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Olfr47-201ENSMUST00000078057 1059 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mrpl24-202ENSMUST00000119968 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm7701-201ENSMUST00000163185 1479 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm22763-201ENSMUST00000158374 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm5174-201ENSMUST00000171131 1423 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm37009-201ENSMUST00000193297 361 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm42423-201ENSMUST00000196396 670 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm45308-201ENSMUST00000210610 415 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Zfp830-201ENSMUST00000056677 1591 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mcu-201ENSMUST00000009791 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm36211-201ENSMUST00000198171 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Nxpe1-ps-201ENSMUST00000209981 1454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm5697-201ENSMUST00000122295 2482 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm15651-201ENSMUST00000159953 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Xaf1-204ENSMUST00000146233 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Rps18-206ENSMUST00000174609 527 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Med11-201ENSMUST00000019067 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm38038-201ENSMUST00000193803 259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm5291-201ENSMUST00000201965 899 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Rassf6-205ENSMUST00000202704 1178 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm45893-201ENSMUST00000211899 247 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Cryab-205ENSMUST00000216755 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm13169-201ENSMUST00000122090 1459 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Arid5a-204ENSMUST00000115032 4640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Hecw1Q8K4P8 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms