Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Trim35Q8C006 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm19074-201ENSMUST00000218915 1429 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Prom2-201ENSMUST00000028855 4796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm10093-201ENSMUST00000079363 1977 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Mup3-203ENSMUST00000107488 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Chn2-203ENSMUST00000114401 1269 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm8310-201ENSMUST00000117526 1193 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 B230307C23Rik-202ENSMUST00000122450 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm5125-201ENSMUST00000148614 624 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 4930441J16Rik-201ENSMUST00000153743 516 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm2539-203ENSMUST00000181352 746 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm27796-201ENSMUST00000183863 261 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ranbp2-ps7-201ENSMUST00000183924 384 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm44243-201ENSMUST00000204323 692 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm7319-201ENSMUST00000210047 778 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Serpina3a-201ENSMUST00000021496 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Defa24-201ENSMUST00000080533 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Olfr1282-201ENSMUST00000099618 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm21750-201ENSMUST00000098874 1497 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm36990-201ENSMUST00000191961 1412 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 4933436I01Rik-201ENSMUST00000026325 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Srsy-201ENSMUST00000179900 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Csn3-203ENSMUST00000113271 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cep19-201ENSMUST00000042869 1567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pdzrn4-202ENSMUST00000169942 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Gm38309-201ENSMUST00000192063 1518 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Trim35Q8C006 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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