Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE2

Atg9a, Autophagy-related protein 9A, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9aQ68FE2 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ankrd7-202ENSMUST00000115396 1157 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm16876-201ENSMUST00000151945 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930402C01Rik-201ENSMUST00000192586 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm18035-201ENSMUST00000211962 589 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AC130477.1-201ENSMUST00000226982 420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930517G19Rik-201ENSMUST00000206152 1676 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm11986-201ENSMUST00000149481 1439 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gsta3-202ENSMUST00000121676 894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Atg9aQ68FE2 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Mtmr4-201ENSMUST00000092802 5525 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Fhitos-201ENSMUST00000160149 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Bet1-201ENSMUST00000049166 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 4930402K13Rik-201ENSMUST00000059967 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Atg9aQ68FE2 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
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