Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm14234-201ENSMUST00000119539 845 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nudt7-204ENSMUST00000134593 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ccl4-201ENSMUST00000019074 660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ighv1-2-201ENSMUST00000195325 378 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pla2g4a-201ENSMUST00000070200 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 4931429L15Rik-201ENSMUST00000159565 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC093022.4-203ENSMUST00000228523 2657 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15074-201ENSMUST00000117603 936 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm18201-201ENSMUST00000174735 875 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm9507-202ENSMUST00000180157 654 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Crygb-201ENSMUST00000027090 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Treml4Q3LRV9 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
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