Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Synpo-211ENSMUST00000155195 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Abcb9-201ENSMUST00000031354 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Cryzl1-202ENSMUST00000114023 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Cryzl1-206ENSMUST00000124282 1187 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Tsc22d1-207ENSMUST00000140251 670 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm28826-201ENSMUST00000190006 488 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 6720482G16Rik-201ENSMUST00000199552 1192 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Emp3-203ENSMUST00000210297 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Ppm1b-203ENSMUST00000112305 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Myzap-201ENSMUST00000093823 2283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Fhl1-202ENSMUST00000114768 1337 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Ighv1-62-3-201ENSMUST00000103532 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm20703-201ENSMUST00000175668 385 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm38103-201ENSMUST00000191707 864 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm43117-201ENSMUST00000198531 379 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 AC124613.1-201ENSMUST00000198711 88 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Sox9Q04887 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms