Protein–RNA interactions for Protein: P80205

Otx1, Homeobox protein OTX1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx1P80205 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Celsr3-207ENSMUST00000213524 9930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 4732490B19Rik-201ENSMUST00000130373 2446 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ncf4-201ENSMUST00000096357 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tnfaip8l3-201ENSMUST00000098760 4403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Col9a1-202ENSMUST00000088349 3059 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pdzd9-203ENSMUST00000208635 1238 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Lhx9-205ENSMUST00000112030 4633 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Otx1P80205 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Otx1P80205 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC9.71□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms