Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm29480-201ENSMUST00000188589 1655 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zfp959-201ENSMUST00000054780 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm12367-202ENSMUST00000146909 2105 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm38359-201ENSMUST00000191884 2225 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm10277-201ENSMUST00000092883 2295 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mob3a-201ENSMUST00000003438 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Rnpc3-201ENSMUST00000092154 3888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 6430571L13Rik-201ENSMUST00000042581 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dscaml1-201ENSMUST00000034592 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Platr4-203ENSMUST00000199155 2161 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Armt1-203ENSMUST00000118544 5044 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Kcnk2-206ENSMUST00000193319 1548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Elovl5-201ENSMUST00000034904 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Diablo-207ENSMUST00000145152 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Sh3bp1P55194 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Smyd1-202ENSMUST00000114186 3292 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Sh3bp1P55194 Dhcr7-211ENSMUST00000207143 1652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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