Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Stkld1-201ENSMUST00000055406 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Btnl7-ps-201ENSMUST00000023469 1763 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Galntl6-208ENSMUST00000204128 5680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm4993-201ENSMUST00000118719 1174 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Calm5-202ENSMUST00000184271 423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 H2afv-202ENSMUST00000109737 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ccdc33-201ENSMUST00000042205 2632 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 4930555B11Rik-201ENSMUST00000123210 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm26737-201ENSMUST00000181106 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm15996-201ENSMUST00000161925 762 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm44759-201ENSMUST00000206057 430 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Hoxc11P31313 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
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