Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Duoxa1-203ENSMUST00000110538 2467 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Mitf-202ENSMUST00000043637 4881 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm364-201ENSMUST00000114725 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Lama3-201ENSMUST00000092070 10548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Eef2-201ENSMUST00000047864 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm7742-201ENSMUST00000167648 1527 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm7732-201ENSMUST00000170486 1527 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm7740-201ENSMUST00000186171 1527 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm7736-201ENSMUST00000096981 1527 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Clcn1-201ENSMUST00000031894 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Il12rb2-201ENSMUST00000018485 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm10748-202ENSMUST00000194396 2379 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Dclk1-203ENSMUST00000167204 6025 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ldlr-201ENSMUST00000034713 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Umodl1-203ENSMUST00000114555 5041 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm44745-201ENSMUST00000206563 2723 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Aplp2-201ENSMUST00000072634 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Slc1a4-202ENSMUST00000109594 3926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Stra6-201ENSMUST00000034880 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Oprl1-205ENSMUST00000108768 2914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm16486-201ENSMUST00000212436 4584 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Pex2-203ENSMUST00000164828 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Klhl7-202ENSMUST00000163409 2857 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Orc4-201ENSMUST00000028098 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Acer2-202ENSMUST00000084433 4060 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ogdh-204ENSMUST00000101554 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Myo18a-201ENSMUST00000000645 7307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Dcun1d2-204ENSMUST00000110840 2853 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Agbl2-201ENSMUST00000037206 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Eif2ak4-203ENSMUST00000110869 1715 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Ap1m2-201ENSMUST00000003397 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Gm8005F6YKY3 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms