Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ilf3Q9Z1X4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ppp1r10-201ENSMUST00000087210 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Disp1-201ENSMUST00000003035 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ddr1-202ENSMUST00000097333 3593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Slc7a1-201ENSMUST00000048116 7179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gmeb1-201ENSMUST00000030733 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fastkd5-201ENSMUST00000110262 3015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Khnyn-201ENSMUST00000022831 3898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Kalrn-205ENSMUST00000114953 4722 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm15513-201ENSMUST00000140646 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Tie1-203ENSMUST00000184261 4234 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Gm9466-201ENSMUST00000218144 2246 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ilf3Q9Z1X4 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms