Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Gpm6b-207ENSMUST00000112229 3203 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Dglucy-201ENSMUST00000069782 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Cfap61-204ENSMUST00000126415 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 2810454H06Rik-201ENSMUST00000189942 3148 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Ly6e-202ENSMUST00000169343 2154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Prc1-202ENSMUST00000163812 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 AC160562.2-201ENSMUST00000216374 2201 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Tram2-201ENSMUST00000037998 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Ap5z1-201ENSMUST00000038699 3689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Hax1-205ENSMUST00000197767 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45781-201ENSMUST00000212860 539 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Atp6v0a4-201ENSMUST00000040259 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 8030423F21Rik-201ENSMUST00000064097 2851 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Trim17-201ENSMUST00000047697 3664 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 5830411N06Rik-203ENSMUST00000164583 3342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Tcn2-205ENSMUST00000109991 1943 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm30228-201ENSMUST00000218501 1949 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gripap1-201ENSMUST00000065932 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Kif3a-202ENSMUST00000118353 2178 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp111-202ENSMUST00000073833 3079 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Subh2bvQ9D9Z7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms