Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY11

PACSIN1, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN1Q9BY11 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TMEM25-201ENST00000313236 2409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PNMA3-202ENST00000593810 1432 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CRELD1-202ENST00000383811 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PACSIN1Q9BY11 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PACSIN1Q9BY11 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms