Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tank-204ENSMUST00000112501 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc4-201ENSMUST00000078734 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Mylk3-202ENSMUST00000121972 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AU041133-202ENSMUST00000201286 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Arhgap6-204ENSMUST00000112129 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gp2-201ENSMUST00000033255 1993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Syk-201ENSMUST00000055087 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Apon-202ENSMUST00000218722 1747 ntAPPRIS P1 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 AI314180-202ENSMUST00000102889 7045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Slitrk3-202ENSMUST00000192477 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Fcamr-202ENSMUST00000112477 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Nhlrc3Q8CCH2 Stox2-206ENSMUST00000210030 2734 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
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