Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Ccl27a-205ENSMUST00000108036 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp47Q8BY87 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp47Q8BY87 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Usp47Q8BY87 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Usp47Q8BY87 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Usp47Q8BY87 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms