Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm29261-201ENSMUST00000188535 678 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fam228a-203ENSMUST00000220978 861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AU017674-201ENSMUST00000222864 720 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC102523.2-201ENSMUST00000227813 983 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Stc2-201ENSMUST00000020546 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm44551-201ENSMUST00000208804 171 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Dsg1bQ7TSF1 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Dsg1bQ7TSF1 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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