Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Gm3402-203ENSMUST00000200228 1154 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm40910-202ENSMUST00000223077 569 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ensa-202ENSMUST00000058230 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm24089-201ENSMUST00000093696 109 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1313-201ENSMUST00000099599 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm13583-202ENSMUST00000151931 1476 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Polr2j-203ENSMUST00000111129 474 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 D3Ertd751e-204ENSMUST00000119572 1011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm8659-201ENSMUST00000120024 1084 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 9230111E07Rik-201ENSMUST00000124850 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Pax5-209ENSMUST00000165417 1056 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 4931440J10Rik-201ENSMUST00000181344 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm29642-201ENSMUST00000186170 921 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AC154407.1-201ENSMUST00000226777 526 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Prr19-201ENSMUST00000080288 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 AC022682.1-201ENSMUST00000224624 2023 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Prss23os-202ENSMUST00000179361 1362 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Kndc1-201ENSMUST00000053445 7299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 A230009B12Rik-202ENSMUST00000159602 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Tmeff1Q6PFE7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms