Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

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Length 1,707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm8122-201ENSMUST00000165988 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm5395-201ENSMUST00000121650 915 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm31557-201ENSMUST00000213825 973 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 AC141884.2-201ENSMUST00000228811 775 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 2010109A12Rik-201ENSMUST00000031330 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Selenbp2-204ENSMUST00000173849 1323 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Thoc6-202ENSMUST00000095579 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gcsam-202ENSMUST00000161347 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm42971-201ENSMUST00000199228 2079 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm6216-201ENSMUST00000182390 687 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ghrl-203ENSMUST00000203588 237 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ascl3-201ENSMUST00000035372 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gdpd2-201ENSMUST00000019503 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Adck1-201ENSMUST00000101165 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Tnni1-204ENSMUST00000139986 651 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm26174-201ENSMUST00000158415 219 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm43460-201ENSMUST00000202491 1057 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Clec2h-202ENSMUST00000204416 386 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Abracl-203ENSMUST00000218994 425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Ormdl2-203ENSMUST00000219215 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Mdc1Q5PSV9 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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