Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Rasal2-204ENSMUST00000132699 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm18294-201ENSMUST00000176980 1748 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm7278-201ENSMUST00000119836 1401 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 C4b-201ENSMUST00000069507 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 AC158605.1-201ENSMUST00000156803 764 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm4811-201ENSMUST00000220879 1220 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 AC153152.3-201ENSMUST00000222188 1135 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2h5-202ENSMUST00000100955 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Rhox3d-ps-201ENSMUST00000119181 825 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Bcl2l12-205ENSMUST00000207755 605 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm45592-201ENSMUST00000209605 1043 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Ssbp4Q3U4B1 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
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