Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Slit2-202ENSMUST00000170109 7758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Slit2-217ENSMUST00000174421 7785 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Enah-201ENSMUST00000078719 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 H2-Q1-202ENSMUST00000105041 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Tomm5-201ENSMUST00000107807 442 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Srd5a3-202ENSMUST00000113506 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm12783-201ENSMUST00000121425 397 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm16081-201ENSMUST00000155992 684 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm9884-201ENSMUST00000194343 1222 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm43380-201ENSMUST00000200421 220 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm18463-201ENSMUST00000207258 474 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 AC168279.1-201ENSMUST00000214611 382 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm7959-201ENSMUST00000221823 1078 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ikzf4-204ENSMUST00000222067 2688 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Lrrc27-201ENSMUST00000016124 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Kyat1-202ENSMUST00000113659 1367 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Sptan1-204ENSMUST00000113717 7958 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Btbd9-201ENSMUST00000079924 6657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Sox5os3-201ENSMUST00000139351 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Gm13609-201ENSMUST00000141023 589 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Cd3eP22646 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms